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Hi, just a few questions which may help:

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">- are you sure your light sheet is aligned well?</div>

<div class="">- are you imaging too deep inside the sample?</div>

<div class="">- did the clearing actually work well, it almost looks like it is just not well cleared?</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">All the best, hope it helps,</div>

<div class="">Stephan</div>

<div class=""><br class="">

<div class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">---</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">

<div class="">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Dr. Stephan Preibisch</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Group Leader</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">

<div class="">Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB), Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC)</div>

<div class="">Building 89, 1.08b</div>

<div class="">Robert-Rössle-Str. 10</div>

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">13125 Berlin</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">email: <a href="mailto:stephan.preibisch@mdc-berlin.de" class="">stephan.preibisch@mdc-berlin.de</a></div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">web: <span class=""><a href="http://preibischlab.mdc-berlin.de" class="">http://preibischlab.mdc-berlin.de</a></span></div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">twitter: <a href="http://twitter.com/preibischs" class="">http://twitter.com/preibischs</a> </div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

</div>

<br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On Nov 20, 2017, at 7:06 PM, 胡衍 <<a href="mailto:huyan1020@sjtu.edu.cn" class="">huyan1020@sjtu.edu.cn</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class="">

<div class="">Hello, everyone.<br class="">

<br class="">

This is Yan.<br class="">

<br class="">

I used my openSPIM to take images for CLARITY brain tissue,<br class="">

and the results as shown in the attachment.<br class="">

I cannot find any structure in these images.<br class="">

<br class="">

Is there anyone knowing such condition?<br class="">

What can I do to improve this condition?<br class="">

<br class="">

I am looking forward for your reply.<br class="">

Best regards,<br class="">

Yan<span id="cid:03E8679B-26F3-4CD5-8389-ADA081089944"><img_13.tif></span><span id="cid:2E9DC298-85D8-4F2E-BFA2-A4C83A75B42C"><img_14.tif></span><span id="cid:816DC9EE-A34B-4914-B9FA-38E45ACCDE39"><img_15.tif></span>_______________________________________________<br class="">

OpenSPIM mailing list<br class="">

<a href="mailto:OpenSPIM@openspim.org" class="">OpenSPIM@openspim.org</a><br class="">

http://openspim.org/mailman/listinfo/openspim<br class="">

</div>

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

</body>

</html>