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<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

Hi, by default the resolution of the output image is equal to the highest resolved dimension, so in your case 0.64x0.64x0.64 um. If you, however, manually apply any scaling during the alignment process it can be different.

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">All the best,</div>

<div class="">Stephan<br class="">

<div class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">---</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Dr. Stephan Preibisch</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Group Leader</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Berlin Institute of Medical Systems Biology of the MDC</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">Building 89, 1.08b</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class=""><br class="">

</div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">email:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:stephan.preibisch@mdc-berlin.de" class="">stephan.preibisch@mdc-berlin.de</a></div>

<div style="orphans: 2; widows: 2;" class="">web: <a href="http://fly.mpi-cbg.de/preibisch" class="">http://www.preibisch.net/</a></div>

</div>

</div>

</div>

<br class="">

<div>

<blockquote type="cite" class="">

<div class="">On 05 Aug 2016, at 08:55, Pavel Tomancak <<a href="mailto:tomancak@mpi-cbg.de" class="">tomancak@mpi-cbg.de</a>> wrote:</div>

<br class="Apple-interchange-newline">

<div class=""><base href="x-msg://238/" class="">

<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; " class="">

<div apple-content-edited="true" class="">

<div style="font-family: Helvetica; font-size: inherit; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-position: normal; font-variant-caps: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-alternates: normal; font-variant-east-asian: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="font-family: Helvetica; font-size: inherit; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-position: normal; font-variant-caps: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-alternates: normal; font-variant-east-asian: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">

<div style="font-size: 12px; " class="">FYI</div>

</div>

</div>

</div>

<div class=""><br class="Apple-interchange-newline">

<blockquote type="cite" class="">

<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px;" class="">

<span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class=""><b class="">From:

</b></span><span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class="">"Anthony, Neil" <<a href="mailto:nantho2@emory.edu" class="">nantho2@emory.edu</a>><br class="">

</span></div>

<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px;" class="">

<span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class=""><b class="">Subject:

</b></span><span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class=""><b class="">[OpenSPIM] Multiview deconvolution - output image scaling</b><br class="">

</span></div>

<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px;" class="">

<span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class=""><b class="">Date:

</b></span><span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class="">August 4, 2016 5:06:15 PM GMT+02:00<br class="">

</span></div>

<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px;" class="">

<span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class=""><b class="">To:

</b></span><span style="font-family: Helvetica; font-size: inherit;" class="">"<a href="mailto:openspim@openspim.org" class="">openspim@openspim.org</a>" <<a href="mailto:openspim@openspim.org" class="">openspim@openspim.org</a>><br class="">

</span></div>

<br class="">

<div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72" style="font-family: Helvetica; font-size: inherit; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-position: normal; font-variant-caps: normal; font-variant-numeric: normal; font-variant-alternates: normal; font-variant-east-asian: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">

<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; ">

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

Hi guys, I hope the scope are treating you well.<o:p class=""></o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

<o:p class=""> </o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

I was wondering what the output image scaling is after the Multiview deconvolution.  I provide the input image scaling of 0.64 x 0.64 x 3 um, and I’m assuming after the different angles have been factored in the output would have a more isotropic scaling…?<o:p class=""></o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

<o:p class=""> </o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

Does anybody know where to find that information?<o:p class=""></o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

<o:p class=""> </o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

Thanks<o:p class=""></o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

Neil<o:p class=""></o:p></div>

<div style="margin: 0in 0in 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; " class="">

<o:p class=""> </o:p></div>

</div>

<br class="">

<hr class="">

<font face="Arial" color="Gray" size="1" class=""><br class="">

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</font>_______________________________________________<br class="">

OpenSPIM mailing list<br class="">

<a href="mailto:OpenSPIM@openspim.org" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; " class="">OpenSPIM@openspim.org</a><br class="">

<a href="http://openspim.org/mailman/listinfo/openspim" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; " class="">http://openspim.org/mailman/listinfo/openspim</a><br class="">

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

</div>

</blockquote>

</div>

<br class="">

</div>

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