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<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 14px; font-family: Calibri, sans-serif;">
<div>
<div>
<div>Hi Gabriel, </div>
<div><br>
</div>
<div>Among the open source options I have had great results with the TeraStitcher plugin for Vaa3d.  See my message about it in another forum here: </div>
<div><br>
</div>
<div><a href="http://lists.umn.edu/cgi-bin/wa?A2=ind1411&L=CONFOCALMICROSCOPY&P=R10149">http://lists.umn.edu/cgi-bin/wa?A2=ind1411&L=CONFOCALMICROSCOPY&P=R10149</a></div>
<div><br>
</div>
<div>Best, </div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Tim</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>Timothy Feinstein, Ph.D. </div>
<div>Research Scientist</div>
<div>University of Pittsburgh Department of Developmental Biology</div>
<div><br>
</div>
</div>
</div>
<div><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family: Calibri; font-size: 11pt; border-width: 1pt medium medium; border-style: solid none none; padding: 3pt 0in 0in; border-top-color: rgb(181, 196, 223);">
<span style="font-weight: bold;">From: </span>Gabriel Davis Jones <<a href="mailto:gabriel.jones@florey.edu.au">gabriel.jones@florey.edu.au</a>><br>
<span style="font-weight: bold;">Date: </span>Saturday, June 27, 2015 at 1:18 AM<br>
<span style="font-weight: bold;">To: </span>"<a href="mailto:openspim@openspim.org">openspim@openspim.org</a>" <<a href="mailto:openspim@openspim.org">openspim@openspim.org</a>><br>
<span style="font-weight: bold;">Subject: </span>[OpenSPIM] Image Stitching Best Practices<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div dir="ltr">
<div fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr; font-family: Tahoma; font-size: 10pt;">Hi All,
<div><br>
</div>
<div><span style="font-size: 10pt;">We are currently imaging large volumes that require us to acquire multiple stacks of the same angle.</span></div>
<div><span style="font-size: 13.3333330154419px;">Is there currently a best way to stitch images acquired OpenSPIM?</span></div>
<div>Should we use the grid/collection stitching plugin or is there a better way to go about it?</div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>Gabriel</div>
</div>
</div>
</div>
</span></div>
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