<div dir="ltr">Richard,<div><br></div><div>The endianness of the TIFF data might be wrong (wrong byte order). Try switching to intel-byte order (or if it already is, switch it to big endian).</div><div><br></div><div>fyi: <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/Endianness">http://en.wikipedia.org/wiki/Endianness</a></div>

<div><br></div><div>cheers,</div><div>Kieran</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 27, 2014 at 8:19 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:Shugi@gmx.de" target="_blank">Shugi@gmx.de</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-family:Verdana;font-size:12.0px"><div>Hello,</div>

<div> </div>

<div>
<div>I read about your tool for registration and fusion of multiple view images. It is the topic of my intership to find a way doing this with our data and I would like to try your tool. But it seems to have a problem with our data. The original data from a Z1 are present as czi file. I extract them as ome.tif file with the ZEN2012 Software. Like in the tutorial the extension was changed from ome.tif to tif. I was following the tutorial and when to interactivlly choosing the threshold for the beads and click "Done" the following Messages occure in the Log:</div>



<div> </div>

<div>Opening first image to determine z-stretching.<br>
Cannot open fie: ...</div>

<div> </div>

<div>The path and the filename are correct. Maybe it is something about the formate? Do you need special tags in the tiff file or does the bit depth has influence?</div>

<div>Hope you can help me, because your tool seems to be very promising.</div>

<div> </div>

<div>Kind regardas</div>

<div>Ricarda Bräuniger</div>
</div></div></div>

<br>_______________________________________________<br>
OpenSPIM mailing list<br>
<a href="mailto:OpenSPIM@openspim.org">OpenSPIM@openspim.org</a><br>
<a href="http://openspim.org/mailman/listinfo/openspim" target="_blank">http://openspim.org/mailman/listinfo/openspim</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>